知网查重会查附录内容的原因主要是为了确保学术论文的原创性和学术诚信。附录部分虽然不属于正文，但也应当遵循学术规范，不应直接复制粘贴他人内容。知网查重系统通过对附录内容进行检测，可以有效发现是否存在抄袭行为，保障学术论文的质量和学术声誉。

另外，知网查重还会查附录内容是因为有些学术论文中的重要内容和数据可能会放在附录部分，这些内容同样需要保持原创性，避免抄袭他人研究成果。因此，知网查重系统会全面检测论文中的所有部分，包括正文和附录，以确保学术论文的学术诚信和质量。